โครงการสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน โรงเรียนนนทรีวิทยา
โรงเรียนนนทรีวิทยา ได้เข้าร่วมเป็นสมาชิกโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืช อันเนื่องมาจากพระราชดำริ
ตั้งแต่ปี พุทธศักราช 2541โดยได้ดำเนินตามโครงการจนได้รับป้ายสนองพระราชดำริ
สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี “สวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน”
เมื่อ วันที่ 19 ตุลาคม 2548 งานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน โรงเรียนนนทรีวิทยา
ได้ตระหนักและเห็นคุณค่าของการสอนและอบรมให้นักเรียนมีจิตสำนึกในการอนุรักษ์พืชพรรณ
โดยการปลูกฝังให้เห็นความงดงาม ความน่าสนใจ เกิดความปีติที่จะทำการศึกษาและอนุรักษ์พืชพรรณ
ให้ครบทุกองค์ ประกอบ ทั้งสาระธรรมชาติแห่งชีวิต สรรพสิ่งล้วนพันเกี่ยว และประโยชน์แท้แก่มหาชน
ทั้งนี้เพื่อเป็นการดำเนินการตามโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริ
สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารีสืบไป